| 年 | 優勝 | スコア | 準優勝 | 甲子園戦績 |
|---|---|---|---|---|
| 1989 | 熊本工 | ３－２ | 東海大二高 | ２回戦 |
| 1990 | 済々黌高 | ４－３ | 熊本工 | ２回戦 |
| 1991 | 熊本工 | ２－０ | 大津高 | 初戦敗退 |
| 1992 | 熊本工 | ４－１ | 城北高 | ２回戦 |
| 1993 | 城北高 | ３－１ | 鎮西高 | 初戦敗退 |
| 1994 | 済々黌高 | ３－０ | 熊本市商 | 初戦敗退 |
| 1995 | 城北高 | ５－３ | 九州学院高 | ２回戦 |
| 1996 | 熊本工 | 15－11 | 東海大二高 | 準優勝 |
| 1997 | 文徳高 | 18－４ | 八代一高 | 初戦敗退 |
| 1998 | 九州学院高 | 16－１ | 熊本工 | 初戦敗退 |
| 1999 | 九州学院高 | ３－２ | 東海大二高 | 初戦敗退 |
| 2000 | 九州学院高 | ４－１ | 八代一高 | ３回戦 |
| 2001 | 秀岳館高 | ６－５ | 熊本工 | ３回戦 |
| 2002 | 熊本工 | ９－５ | 九州学院高 | 初戦敗退 |
| 2003 | 必由館高 | ５－１ | 文徳高 | 初戦敗退 |
| 2004 | 熊本工 | ９－１ | 秀岳館高 | ２回戦 |
| 2005 | 熊本工 | ６－５ | 文徳高 | 初戦敗退 |
| 2006 | 熊本工 | 15－５ | 専大玉名高 | ３回戦 |
| 2007 | 八代東高 | ８－６ | 九州学院高 | 初戦敗退 |
| 2008 | 城北高 | 11－４ | 専大玉名高 | 初戦敗退 |
| 2009 | 熊本工 | ７－６ | 九州学院高 | 初戦敗退 |
| 2010 | 九州学院高 | ７－３ | 八代東高 | ベスト８ |
| 2011 | 専大玉名高 | １－０ | 熊本工 | 初戦敗退 |
| 2012 | 済々黌高 | ７－３ | 必由館高 | ３回戦 |
| 2013 | 熊本工 | ５－４ | 文徳高 | ２回戦 |
| 2014 | 城北高 | ２－１ | 文徳高 | ３回戦 |
| 2015 | 九州学院高 | ６－２ | 文徳高 | 初戦敗退 |
| 2016 | 秀岳館高 | 13－２ | 九州学院高 | ベスト４ |
| 2017 | 秀岳館高 | ３－１ | 九州学院高 | ２回戦 |
| 2018 | 東海大熊本星翔高 | ６－４ | 熊本工 | 初戦敗退 |
| 2019 | 熊本工 | ７－５ | 九州学院高 | ２回戦 |
| 2020 | ― | ― | ― | （中止） |
| 2021 | 熊本工 | 15－２ | 熊本北高 | 初戦敗退 |
| 2022 | 九州学院高 | ６－０ | 秀岳館高 | ベスト８ |
| 2023 | 東海大熊本星翔高 | ５－０ | 九州学院高 | 初戦敗退 |
| 2024 | 熊本工 | ６－２ | 熊本国府高 | 初戦敗退 |
| 2025 | 東海大熊本星翔高 | ４－２ | 有明高 | ２回戦 |
※2020年は地区大会のみ開催