| 昭和38年夏 | １回戦 | ○ | 宮崎商８－１函館工 |
| ２回戦 | ● | 宮崎商１－２甲府商 | |
| 昭和39年夏 | １回戦 | ○ | 宮崎商２－０旭川南高 | ２回戦 | ○ | 宮崎商４－１滝川高 |
| 準々決勝 | ○ | 宮崎商５－１熊谷商工 | |
| 準決勝 | ● | 宮崎商０－１高知高 | |
| 昭和41年春 | １回戦 | ● | 宮崎商１－５大宮高 |
| 昭和44年春 | １回戦 | ● | 宮崎商０－５銚子商 |
| 昭和44年夏 | １回戦 | ● | 宮崎商０－１明星高 |
| 平成20年夏 | １回戦 | ○ | 宮崎商７－１城北高 |
| ２回戦 | ● | 宮崎商１－４鹿児島実(延長12回) | |
| 令和３年春 | １回戦 | ● | 宮崎商１－７天理高 |
| 令和３年夏 | ２回戦 | ● | 宮崎商 (不戦敗) 智弁和歌山高 |
| 令和６年夏 | １回戦 | ● | 宮崎商３－４中京大中京高 |