| 昭和56年夏 | １回戦 | ● | 佐賀学園高０－１浜松西高 |
| 平成２年夏 | １回戦 | ● | 佐賀学園高７－12甲府工 |
| 平成３年夏 | １回戦 | ○ | 佐賀学園高３－２春日部共栄高(延長10回) |
| ２回戦 | ○ | 佐賀学園高３－１天理高 | |
| ３回戦 | ● | 佐賀学園高２－６柳川高 | |
| 平成10年夏 | １回戦 | ○ | 佐賀学園高３－２佐久長聖高(延長11回) |
| ２回戦 | ○ | 佐賀学園高４－２埼玉栄高 | |
| ３回戦 | ● | 佐賀学園高１－５ＰＬ学園高 | |
| 平成16年夏 | １回戦 | ● | 佐賀学園高５－10富山商 |
| 平成22年夏 | １回戦 | ○ | 佐賀学園高５－１旭川実 |
| ２回戦 | ○ | 佐賀学園高３－２長崎日大高 | |
| ３回戦 | ● | 佐賀学園高５－13報徳学園高 |