| 昭和59年春 | １回戦 | ○ | 私神港高７－２法政一高 |
| ２回戦 | ● | 私神港高１－３都城高 | |
| 昭和63年春 | ２回戦 | ● | 神港学園高２－３福島北高 |
| 平成４年夏 | １回戦 | ○ | 神港学園高３－２北海高 |
| ２回戦 | ○ | 神港学園高11－４一関商工 | |
| ３回戦 | ● | 神港学園高３－４池田高 | |
| 平成７年春 | １回戦 | ○ | 神港学園高４－３仙台育英高 |
| ２回戦 | ○ | 神港学園高４－３大府高 | |
| 準々決勝 | ● | 神港学園高４－５今治西高(延長13回) | |
| 平成８年夏 | １回戦 | ● | 神港学園高１－16仙台育英高 |
| 平成15年夏 | １回戦 | ● | 神港学園高２－９桐生第一高 |
| 平成18年春 | １回戦 | ○ | 神港学園高４－０南陽工 |
| ２回戦 | ○ | 神港学園高２－０成田高 | |
| 準々決勝 | ● | 神港学園高０－４岐阜城北高 | |
| 平成22年春 | １回戦 | ○ | 神港学園高６－５高知高 |
| ２回戦 | ● | 神港学園高１－２中京大中京高 |