| 昭和56年夏 | １回戦 | ○ | 近江高４－３鶴商学園高 |
| ２回戦 | ● | 近江高０－２和歌山工 | |
| 平成４年夏 | １回戦 | ● | 近江高１－８樹徳高 |
| 平成６年夏 | １回戦 | ○ | 近江高５－４志学館高 |
| ２回戦 | ● | 近江高４－14柳ヶ浦高 | |
| 平成８年夏 | １回戦 | ● | 近江高１－６早実 |
| 平成10年春 | ２回戦 | ● | 近江高３－６日大藤沢高 |
| 平成10年夏 | ２回戦 | ● | 近江高３－10常総学院高 |
| 平成13年夏 | ２回戦 | ○ | 近江高４－１盛岡大付高 |
| ３回戦 | ○ | 近江高11－１塚原青雲高 | |
| 準々決勝 | ○ | 近江高８－６光星学院高 | |
| 準決勝 | ○ | 近江高５－４松山商 | |
| 決 勝 | ● | 準優勝近江高２－５日大三高 | |
| 平成15年春 | ２回戦 | ○ | 近江高４－３宜野座高 |
| ３回戦 | ○ | 近江高４－０愛工大名電高 | |
| 準々決勝 | ● | 近江高２－４広陵高 | |
| 平成15年夏 | １回戦 | ○ | 近江高９－５宇治山田商 |
| ２回戦 | ● | 近江高１－３東北高 | |
| 平成17年夏 | １回戦 | ● | 近江高８－９桐光学園高 |
| 平成19年夏 | １回戦 | ○ | 近江高９－３松商学園高 |
| ２回戦 | ● | 近江高０－１今治西高 | |
| 平成20年夏 | １回戦 | ● | 近江高４－５智弁学園高 |
| 平成24年春 | １回戦 | 近江高０－０高崎高 (３回裏降雨ノーゲーム) |
|
| ○ | 近江高７－２高崎高 | ||
| ２回戦 | ● | 近江高１－13光星学院高 | |
| 平成26年夏 | ２回戦 | ○ | 近江高８－０鳴門高 |
| ３回戦 | ● | 近江高１－２聖光学院高 | |
| 平成27年春 | １回戦 | ○ | 近江高２－０九産大九州高 |
| ２回戦 | ● | 近江高０－３県岐阜商 | |
| 平成28年夏 | １回戦 | ● | 近江高０－11常総学院高 |
| 平成30年春 | ２回戦 | ○ | 近江高８－５松山聖陵高 |
| ３回戦 | ● | 近江高３－４星稜高(延長10回) | |
| 平成30年夏 | １回戦 | ○ | 近江高７－３智弁和歌山高 |
| ２回戦 | ○ | 近江高４－３前橋育英高 | |
| ３回戦 | ○ | 近江高９－４常葉大菊川高 | |
| 準々決勝 | ● | 近江高２－３金足農 | |
| 令和元年夏 | ２回戦 | ● | 近江高１－６東海大相模高 |
| 令和３年夏 | １回戦 | 近江高１－０日大東北高(５回裏途中降雨ノーゲーム) | |
| ○ | 近江高８－２日大東北高 | ||
| ２回戦 | ○ | 近江高６－４大阪桐蔭高 | |
| ３回戦 | ○ | 近江高７－４盛岡大付高 | |
| 準々決勝 | ○ | 近江高７－６神戸国際大付高 | |
| 準決勝 | ● | 近江高１－５智弁和歌山高 | |
| 令和４年春 | １回戦 | ○ | 近江高６－２長崎日大高(延長13回ＴＢ) |
| ２回戦 | ○ | 近江高７－２聖光学院高 | |
| 準々決勝 | ○ | 近江高６－１金光大阪高 | |
| 準決勝 | ○ | 近江高５－２浦和学院高(延長11回) | |
| 決 勝 | ● | 準優勝近江高１－18大阪桐蔭高 | |
| 令和４年夏 | １回戦 | ○ | 近江高８－２鳴門高 |
| ２回戦 | ○ | 近江高８－３鶴岡東高 | |
| ３回戦 | ○ | 近江高７－１海星高 | |
| 準々決勝 | ○ | 近江高７－６高松商 | |
| 準決勝 | ● | 近江高２－８下関国際高 | |
| 令和５年夏 | １回戦 | ● | 近江高２－７大垣日大高 |
| 令和６年春 | １回戦 | ● | 近江高１－２熊本国府高(延長10回ＴＢ) |