| 昭和43年夏 | ２回戦 | ○ | 智弁学園高６－０前橋工 |
| ３回戦 | ● | 智弁学園高２－７秋田市立高 | |
| 昭和51年春 | １回戦 | ○ | 智弁学園高５－０札幌商 |
| ２回戦 | ○ | 智弁学園高４－３岡崎工 | |
| 準々決勝 | ● | 智弁学園高３－11東洋大姫路高 | |
| 昭和52年春 | １回戦 | ○ | 智弁学園高４－２土浦日大高 |
| ２回戦 | ○ | 智弁学園高４－１銚子商 | |
| 準々決勝 | ○ | 智弁学園高４－２早実 | |
| 準決勝 | ● | 智弁学園高０－２箕島高 | |
| 昭和52年夏 | １回戦 | ○ | 智弁学園高２－１星稜高 |
| ２回戦 | ○ | 智弁学園高12－０川口工 | |
| ３回戦 | ● | 智弁学園高０－４今治西高 | |
| 昭和56年夏 | １回戦 | ● | 智弁学園高１－６岐阜南高 |
| 昭和57年夏 | １回戦 | ● | 智弁学園高２－３法政二高 |
| 昭和59年春 | １回戦 | ● | 智弁学園高３－９拓大紅陵高 |
| 昭和59年夏 | １回戦 | ● | 智弁学園高８－９浜松商 |
| 昭和60年夏 | １回戦 | ● | 智弁学園高１－２東京農大二高(延長10回) |
| 昭和61年春 | １回戦 | ● | 智弁学園高０－２函館有斗高 |
| 平成元年夏 | １回戦 | ○ | 智弁学園高６－１新潟南高 |
| ２回戦 | ○ | 智弁学園高６－２東京農大二高 | |
| ３回戦 | ● | 智弁学園高０－２海星高 | |
| 平成２年春 | １回戦 | ● | 智弁学園高０－１東北高 |
| 平成５年春 | ２回戦 | ● | 智弁学園高３－５長崎日大高 |
| 平成７年夏 | ２回戦 | ○ | 智弁学園高10－０高岡商 |
| ３回戦 | ○ | 智弁学園高５－２青森山田高 | |
| 準々決勝 | ○ | 智弁学園高８－６ＰＬ学園高 | |
| 準決勝 | ● | 智弁学園高１－３星稜高 | |
| 平成９年夏 | ２回戦 | ○ | 智弁学園高12－３酒田南高 |
| ３回戦 | ● | 智弁学園高１－６前橋工 | |
| 平成10年夏 | １回戦 | ○ | 智弁学園高６－２滝川西高 |
| ２回戦 | ● | 智弁学園高３－４桜美林高 | |
| 平成11年夏 | ２回戦 | ○ | 智弁学園高９－２県岐阜商 |
| ３回戦 | ● | 智弁学園高５－９桐蔭学園高 |
| 平成13年春 | ２回戦 | ● | 智弁学園高２－５桐光学園高 |
| 平成13年夏 | １回戦 | ○ | 智弁学園高13－２静岡市立高 |
| ２回戦 | ○ | 智弁学園高３－０前橋工 | |
| ３回戦 | ● | 智弁学園高３－４松山商 | |
| 平成14年夏 | １回戦 | ○ | 智弁学園高６－０拓大紅陵高 |
| ２回戦 | ○ | 智弁学園高３－０海星高 | |
| ３回戦 | ● | 智弁学園高３－７智弁和歌山高 | |
| 平成19年夏 | １回戦 | ○ | 智弁学園高12－２尽誠学園高 |
| ２回戦 | ○ | 智弁学園高５－２仙台育英高 | |
| ３回戦 | ● | 智弁学園高０－６帝京高 | |
| 平成20年夏 | １回戦 | ○ | 智弁学園高５－４近江高 |
| ２回戦 | ● | 智弁学園高４－５報徳学園高(延長10回) | |
| 平成23年夏 | ２回戦 | ○ | 智弁学園高２－１鶴岡東高 |
| ３回戦 | ○ | 智弁学園高９－４横浜高 | |
| 準々決勝 | ● | 智弁学園高６－７作新学院高 | |
| 平成24年春 | １回戦 | ○ | 智弁学園高５－２早鞆高 |
| ２回戦 | ● | 智弁学園高１－２関東第一高 | |
| 平成26年春 | １回戦 | ○ | 智弁学園高７－２三重高 |
| ２回戦 | ● | 智弁学園高４－５佐野日大高(延長10回) | |
| 平成26年夏 | １回戦 | ● | 智弁学園高４－10明徳義塾高 |
| 平成28年春 | １回戦 | ○ | 智弁学園高４－０福井工大福井高 |
| ２回戦 | ○ | 智弁学園高４－１鹿児島実 | |
| 準々決勝 | ○ | 智弁学園高６－０滋賀学園高 | |
| 準決勝 | ○ | 智弁学園高２－１龍谷大平安高 テーブルスコア | |
| 決 勝 | ○ | 優勝智弁学園高２－１高松商(延長11回) テーブルスコア |
|
| 平成28年夏 | １回戦 | ○ | 智弁学園高６－１出雲高 |
| ２回戦 | ● | 智弁学園高２－５鳴門高 テーブルスコア | |
| 平成29年春 | １回戦 | ○ | 智弁学園高９－０熊本工 |
| ２回戦 | ● | 智弁学園高１－５盛岡大付高 | |
| 平成30年春 | ２回戦 | ○ | 智弁学園高５－３日大山形高 |
| ３回戦 | ● | 智弁学園高１－２創成館高(延長10回) | |
| 令和元年夏 | ２回戦 | ● | 智弁学園高８－10八戸学院光星高 |
| 令和２年春 | 中 止 | ||
| 令和３年春 | １回戦 | ○ | 智弁学園高８－６大阪桐蔭高 |
| ２回戦 | ○ | 智弁学園高５－２広島新庄高 | |
| 準々決勝 | ● | 智弁学園高４－６明豊高 | |
| 令和３年夏 | １回戦 | ○ | 智弁学園高10－３倉敷商 |
| ２回戦 | ○ | 智弁学園高５－０横浜高 | |
| ３回戦 | ○ | 智弁学園高７－１日本航空高 | |
| 準々決勝 | ○ | 智弁学園高３－２明徳義塾高 | |
| 準決勝 | ○ | 智弁学園高３－１京都国際高 | |
| 決 勝 | ● | 準優勝智弁学園高２－９智弁和歌山高 | |
| 令和５年夏 | １回戦 | ○ | 智弁学園高７－６英明高(延長10回ＴＢ) |
| ２回戦 | ○ | 智弁学園高12－６徳島商 | |
| ３回戦 | ● | 智弁学園高２－５花巻東高 |
| 令和２年 | ● | 智弁学園高３－４中京大中京高(延長10回タイブレーク) |